Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms