Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D5Q8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D5Q8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D5Q8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D5Q8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D5Q8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D5Q8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D5Q8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D5Q8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D5Q8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D5Q8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D5Q8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms