Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms