Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp4Q99ME9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms