Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gps1Q99LD4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms