Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep57l1Q8VDS7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms