Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem260Q8BMD6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Tmem260Q8BMD6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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