Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms