Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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