Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Atg9aQ68FE2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms