Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn13Q64512 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn13Q64512 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptpn13Q64512 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn13Q64512 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms