Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Znf260Q62513 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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