Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms