Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psme4Q5SSW2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme4Q5SSW2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms