Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WhammQ571B6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WhammQ571B6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms