Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2cd3Q52KB6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2cd3Q52KB6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms