Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam228bQ497Q6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms