Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm906Q3V0M1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms