Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3UST5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3UST5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3UST5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3UST5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3UST5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3UST5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3UST5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UST5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UST5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UST5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UST5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UST5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3UST5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3UST5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UST5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UST5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms