Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uspl1Q3ULM6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uspl1Q3ULM6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uspl1Q3ULM6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uspl1Q3ULM6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uspl1Q3ULM6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uspl1Q3ULM6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uspl1Q3ULM6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Uspl1Q3ULM6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uspl1Q3ULM6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uspl1Q3ULM6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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