Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lmod2Q3UHZ5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmod2Q3UHZ5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmod2Q3UHZ5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmod2Q3UHZ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod2Q3UHZ5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lmod2Q3UHZ5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms