Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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