Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms