Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc10Q3TLI0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc10Q3TLI0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms