Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Xrn1P97789 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms