Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmklr1P97468 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms