Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnikP83510 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnikP83510 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnikP83510 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnikP83510 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnikP83510 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnikP83510 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TnikP83510 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnikP83510 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnikP83510 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnikP83510 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnikP83510 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnikP83510 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TnikP83510 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TnikP83510 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TnikP83510 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TnikP83510 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TnikP83510 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TnikP83510 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TnikP83510 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnikP83510 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnikP83510 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnikP83510 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnikP83510 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnikP83510 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnikP83510 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnikP83510 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnikP83510 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnikP83510 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnikP83510 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnikP83510 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnikP83510 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnikP83510 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnikP83510 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnikP83510 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnikP83510 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnikP83510 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnikP83510 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnikP83510 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnikP83510 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnikP83510 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnikP83510 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnikP83510 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnikP83510 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnikP83510 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnikP83510 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnikP83510 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnikP83510 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnikP83510 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnikP83510 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnikP83510 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnikP83510 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnikP83510 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnikP83510 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnikP83510 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnikP83510 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnikP83510 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnikP83510 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnikP83510 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnikP83510 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnikP83510 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnikP83510 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms