Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox2P48432 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox2P48432 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox2P48432 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms