Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5cP41230 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5cP41230 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5cP41230 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5cP41230 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5cP41230 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5cP41230 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5cP41230 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5cP41230 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5cP41230 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5cP41230 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms