Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TfamP40630 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TfamP40630 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TfamP40630 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TfamP40630 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TfamP40630 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TfamP40630 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TfamP40630 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfamP40630 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfamP40630 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TfamP40630 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TfamP40630 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TfamP40630 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TfamP40630 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfamP40630 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms