Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms