Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf1aP25118 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms