Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxb3P09026 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms