Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01725 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01725 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01725 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01725 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01725 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01725 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01725 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01725 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01725 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01725 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01725 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01725 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01725 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01725 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01725 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01725 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01725 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01725 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01725 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01725 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01725 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01725 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms