Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01666 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01666 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01666 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01666 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01666 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01666 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01666 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01666 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01666 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01666 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01666 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01666 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01666 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01666 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01666 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01666 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01666 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01666 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01666 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01666 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01666 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01666 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms