Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc4a4O88343 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms