Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna3O08545 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna3O08545 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna3O08545 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms