Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms