Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem200cJ3QK46 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms