Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms