Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20425E9Q035 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm20425E9Q035 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20425E9Q035 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms