Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprbB2RU80 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.7 ms