Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn7aB1AYL1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn7aB1AYL1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn7aB1AYL1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms