Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms