Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpv2Q9WTR1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv2Q9WTR1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.3 ms