Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb1bp2Q9R000 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb1bp2Q9R000 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms