Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Six6Q9QZ28 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms