Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snap29Q9ERB0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms