Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx12Q9ER00 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx12Q9ER00 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx12Q9ER00 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx12Q9ER00 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx12Q9ER00 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx12Q9ER00 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms