Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox9Q9EQM5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms